尽管现在的平板离心机有的是自动配平的，但对称放置的物体重量差也要有个限度，一般仪器说明书上都要求在几克之内。我们知道，离心的两个物体，一旦重量不相等，势必发生剧烈的震动。自动配平的离心机的自动配平原理类似洗衣机的脱水桶，将离心转子头和驱动电机作为一个整体通过三根弹簧与机体相连，由于有弹簧的存在，不平时会有个倾斜，自身不平引起的震动会小一些，而且传给外壳也少多了，外加外壳部分也很重，外部感觉震动很小，也就是实现了所谓的自动平衡。但实际上转动部分内部体系（电机+离心转头等）震动还是很厉害的，既然转的时候有震动，而且这个震动是径向的（跟电机轴是垂直的），电机轴承平时应该是最好没有这个力，一旦有这个力的存在，电机轴承久而久之就容易磨损，提前报废。有的离心机因不平衡导致轴承早早地牺牲，轴承跟轴承座之间都能塞几张纸进去。不平衡所引起的力是很大的，时间长可能引起疲劳，也要注意有可能导致的断轴事故。
所以，从这一点来说，最好使对称放置的提篮能放天平两个托盘上放一下，一般就是拔掉几个帽子的事。平了以后别的好处就是声音非常小，能够迅速升到预设的速度。
我们在使用平板离心机时，一定要注意配平。具体是在往转子中放置样品时，要采用相同密度的样品、等量轴对称放置。特别注意不是简单的对称，而是轴对称，既以离心机驱动（轴）为对称点（轴）的对称方式，这样才能保证转子旋转起来后的动平衡。